This is the complete list of members for src.smirnoffio.SMIRNOFF, including all inherited members.
| __init__(self, name="openmm", kwargs) | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| A | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| abspdb | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| AtomLists | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| AtomMask | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| B | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| forcefield | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| freeze_atoms | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| get_smirks_counter(self) | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| interaction_energy(self, fraga, fragb) | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| mmopts | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| mod | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| mol | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| mol2 | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| name | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| nbcharges | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| off_topology | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| offxml | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| optimize(self, shot=0, align=True, crit=1e-4) | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| pbc | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| pdb | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| prepare(self, pbc=False, mmopts={}, kwargs) | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| readsrc(self, kwargs) | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| realAtomIdxs | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| ref_mol | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| restrain_k | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| simkwargs | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| system | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| update_simulation(self, kwargs) | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| valkwd | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |
| xyz_omms | src.smirnoffio.SMIRNOFF | |