src.tinkerio.TINKER Member List

This is the complete list of members for src.tinkerio.TINKER, including all inherited members.

__init__(self, name="tinker", kwargs)	src.tinkerio.TINKER
A	src.tinkerio.TINKER
abskey	src.tinkerio.TINKER
AtomLists	src.tinkerio.TINKER
AtomMask	src.tinkerio.TINKER
B	src.tinkerio.TINKER
calltinker(self, command, stdin=None, print_to_screen=False, print_command=False, kwargs)	src.tinkerio.TINKER
energy(self)	src.tinkerio.TINKER
energy_dipole(self)	src.tinkerio.TINKER
energy_force(self)	src.tinkerio.TINKER
energy_force_one(self, shot)	src.tinkerio.TINKER
energy_rmsd(self, shot=0, optimize=True)	src.tinkerio.TINKER
evaluate_(self, xyzin, force=False, dipole=False)	src.tinkerio.TINKER
get_charges(self)	src.tinkerio.TINKER
interaction_energy(self, fraga, fragb)	src.tinkerio.TINKER
key	src.tinkerio.TINKER
md_trajectory	src.tinkerio.TINKER
mol	src.tinkerio.TINKER
molecular_dynamics(self, nsteps, timestep, temperature=None, pressure=None, nequil=0, nsave=1000, minimize=True, anisotropic=False, threads=1, verbose=False, kwargs)	src.tinkerio.TINKER
multipole_moments(self, shot=0, optimize=True, polarizability=False)	src.tinkerio.TINKER
normal_modes(self, shot=0, optimize=True)	src.tinkerio.TINKER
optimize(self, shot, method="newton", align=True, crit=1e-4)	src.tinkerio.TINKER
pbc	src.tinkerio.TINKER
prepare(self, pbc=False, kwargs)	src.tinkerio.TINKER
prm	src.tinkerio.TINKER
readsrc(self, kwargs)	src.tinkerio.TINKER
rigid	src.tinkerio.TINKER
setopts(self, kwargs)	src.tinkerio.TINKER
tinkerpath	src.tinkerio.TINKER
valkwd	src.tinkerio.TINKER
warn_vn	src.tinkerio.TINKER