Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:
- e -
- e_ctr
: src.abinitio.AbInitio
- e_err
: src.abinitio.AbInitio
, src.interaction.Interaction
- e_err_pct
: src.abinitio.AbInitio
, src.interaction.Interaction
- e_ref
: src.abinitio.AbInitio
- e_trm
: src.abinitio.AbInitio
- edit_qcrems()
: src.molecule.Molecule
- element
: src.psi4io.GBS_Reader
, src.psi4io.Grid_Reader
- elements
: src.psi4io.RDVR3_Psi4
- Elements
: src.psi4io.THCDF_Psi4
- emit()
: src.molecule.RawStreamHandler
, src.nifty.RawFileHandler
, src.nifty.RawStreamHandler
, src.output.CleanFileHandler
, src.output.CleanStreamHandler
, src.output.RawFileHandler
, src.output.RawStreamHandler
- emm
: src.interaction.Interaction
- emm_orig
: src.torsion_profile.TorsionProfileTarget
- energy()
: src.amberio.AMBER
, src.gmxio.GMX
, src.tinkerio.TINKER
- energy_all()
: src.abinitio.AbInitio
- energy_asymmetry
: src.abinitio.AbInitio
- energy_dipole()
: src.amberio.AMBER
, src.gmxio.GMX
, src.tinkerio.TINKER
- energy_force()
: src.amberio.AMBER
, src.gmxio.GMX
, src.tinkerio.TINKER
- energy_force_all()
: src.abinitio.AbInitio
- energy_force_driver_all()
: src.abinitio_internal.AbInitio_Internal
- energy_force_one()
: src.abinitio.AbInitio
, src.amberio.AMBER
, src.gmxio.GMX
, src.tinkerio.TINKER
- energy_force_transform()
: src.abinitio.AbInitio
- energy_force_transform_one()
: src.abinitio.AbInitio
- energy_one()
: src.abinitio.AbInitio
, src.gmxio.GMX
- energy_part
: src.binding.BindingEnergy
- energy_rmsd()
: src.amberio.AMBER
, src.gmxio.GMX
, src.tinkerio.TINKER
- energy_termnames()
: src.gmxio.GMX
- engine
: src.abinitio.AbInitio
, src.interaction.Interaction
, src.moments.Moments
, src.torsion_profile.TorsionProfileTarget
, src.vibration.Vibration
- engine_
: src.amberio.AbInitio_AMBER
, src.amberio.Interaction_AMBER
, src.amberio.Liquid_AMBER
, src.amberio.Vibration_AMBER
, src.gmxio.AbInitio_GMX
, src.gmxio.BindingEnergy_GMX
, src.gmxio.Interaction_GMX
, src.gmxio.Lipid_GMX
, src.gmxio.Liquid_GMX
, src.gmxio.Moments_GMX
, src.gmxio.Thermo_GMX
, src.gmxio.Vibration_GMX
, src.smirnoffio.AbInitio_SMIRNOFF
, src.smirnoffio.Liquid_SMIRNOFF
, src.smirnoffio.OptGeoTarget_SMIRNOFF
, src.smirnoffio.TorsionProfileTarget_SMIRNOFF
, src.smirnoffio.Vibration_SMIRNOFF
, src.tinkerio.AbInitio_TINKER
, src.tinkerio.BindingEnergy_TINKER
, src.tinkerio.Interaction_TINKER
, src.tinkerio.Liquid_TINKER
, src.tinkerio.Moments_TINKER
, src.tinkerio.Vibration_TINKER
- engine_opts
: src.hydration.Hydration
- engines
: src.binding.BindingEnergy
, src.hydration.Hydration
, src.smirnoffio.OptGeoTarget_SMIRNOFF
- engname
: src.amberio.Liquid_AMBER
, src.gmxio.Lipid_GMX
, src.gmxio.Liquid_GMX
, src.gmxio.Thermo_GMX
, src.lipid.Lipid
, src.liquid.Liquid
, src.quantity.Quantity
, src.quantity.Quantity_Density
, src.quantity.Quantity_H_vap
, src.smirnoffio.Liquid_SMIRNOFF
, src.tinkerio.Liquid_TINKER
- eqm
: src.abinitio.AbInitio
, src.interaction.Interaction
, src.torsion_profile.TorsionProfileTarget
- error()
: src.output.ModLogger
- esp_ctr
: src.abinitio.AbInitio
- esp_err
: src.abinitio.AbInitio
- esp_err_pct
: src.abinitio.AbInitio
- esp_ref
: src.abinitio.AbInitio
- esp_trm
: src.abinitio.AbInitio
- espval
: src.abinitio.AbInitio
- espxyz
: src.abinitio.AbInitio
- estimation_options
: src.evaluator_io.Evaluator_SMIRNOFF.OptionsFile
- evaluate_()
: src.gmxio.GMX
, src.tinkerio.TINKER
- evaluate_cpptraj()
: src.amberio.AMBER
- evaluate_sander()
: src.amberio.AMBER
- evaluate_snapshot()
: src.gmxio.GMX
- evaluate_trajectory()
: src.gmxio.GMX
- evaluated
: src.target.Target
- excision
: src.ffyapf.FF
, src.forcefield.FF
, src.optimizer.Optimizer
- experr
: src.hydration.Hydration
- expval
: src.hydration.Hydration
- extra_output
: src.amberio.Liquid_AMBER
, src.gmxio.Lipid_GMX
, src.gmxio.Liquid_GMX
, src.hydration.Hydration
, src.lipid.Lipid
, src.liquid.Liquid
, src.smirnoffio.Liquid_SMIRNOFF
, src.tinkerio.Liquid_TINKER
- extract()
: src.quantity.Quantity
, src.quantity.Quantity_Density
, src.quantity.Quantity_H_vap