- c -

• calc_scd() : src.gmxio.GMX
• callamber() : src.amberio.AMBER
• callgmx() : src.gmxio.GMX
• calltinker() : src.tinkerio.TINKER
• center() : src.molecule.Molecule
• center_of_mass() : src.molecule.Molecule
• check_dupes() : src.ffyapf.FF , src.forcefield.FF
• check_files() : src.lipid.Lipid , src.liquid.Liquid , src.target.Target
• close() : src.nifty.LineChunker
• compute() : src.objective.Penalty
• compute_netforce_torque() : src.abinitio.AbInitio
• ConjugateGradient() : src.optimizer.Optimizer
• create_engines() : src.opt_geo_target.OptGeoTarget , src.smirnoffio.OptGeoTarget_SMIRNOFF
• create_mvals() : src.ffyapf.FF , src.forcefield.FF
• create_pvals() : src.ffyapf.FF , src.forcefield.FF