- g -

• generate_positions() : src.gmxio.GMX
• GeneticAlgorithm() : src.optimizer.Optimizer
• get() : src.abinitio.AbInitio , src.binding.BindingEnergy , src.counterpoise.Counterpoise , src.evaluator_io.Evaluator_SMIRNOFF , src.hydration.Hydration , src.interaction.Interaction , src.leastsq.LeastSquares , src.lipid.Lipid , src.liquid.Liquid , src.moments.Moments , src.opt_geo_target.OptGeoTarget , src.psi4io.RDVR3_Psi4 , src.target.RemoteTarget , src.target.Target , src.thermo.Thermo , src.torsion_profile.TorsionProfileTarget , src.vibration.Vibration
• get14Interactions() : src.amberio.PrmtopLoader
• get_atom() : src.Mol2.mol2
• get_bonded_atoms() : src.Mol2.mol2
• get_charges() : src.amberio.AMBER , src.gmxio.GMX , src.tinkerio.TINKER
• get_energy_force() : src.abinitio.AbInitio
• get_exp() : src.hydration.Hydration
• get_G() : src.target.Target
• get_H() : src.target.Target
• get_mathid() : src.forcefield.FF
• get_normal() : src.liquid.Liquid
• get_populations() : src.molecule.Molecule
• get_pure_num_grad() : src.liquid.Liquid
• get_reaxff_atom_types() : src.molecule.Molecule
• get_resp() : src.abinitio.AbInitio
• get_smirks_counter() : src.smirnoffio.SMIRNOFF
• get_sp() : src.hydration.Hydration
• get_ti2() : src.hydration.Hydration
• get_X() : src.target.Target
• getAngles() : src.amberio.PrmtopLoader
• getAtomName() : src.amberio.PrmtopLoader
• getAtomNames() : src.amberio.PrmtopLoader
• getAtomType() : src.amberio.PrmtopLoader
• getAtomTypes() : src.amberio.PrmtopLoader
• getBondsNoH() : src.amberio.PrmtopLoader
• getBondsWithH() : src.amberio.PrmtopLoader
• getBoxBetaAndDimensions() : src.amberio.PrmtopLoader
• getCharges() : src.amberio.PrmtopLoader
• getDihedrals() : src.amberio.PrmtopLoader
• getExcludedAtoms() : src.amberio.PrmtopLoader
• getGBParms() : src.amberio.PrmtopLoader
• getIfBox() : src.amberio.PrmtopLoader
• getIfCap() : src.amberio.PrmtopLoader
• getIfPert() : src.amberio.PrmtopLoader
• getMasses() : src.amberio.PrmtopLoader
• getNonbondTerms() : src.amberio.PrmtopLoader
• getNumAtoms() : src.amberio.PrmtopLoader
• getNumTypes() : src.amberio.PrmtopLoader
• getResidueLabel() : src.amberio.PrmtopLoader
• getResidueNumber() : src.amberio.PrmtopLoader
• Gradient() : src.optimizer.Optimizer