ForceBalance API
1.3
Automated optimization of force fields and empirical potentials
- r -
radius_of_gyration() :
src.molecule.Molecule
read() :
src.liquid.Liquid
,
src.target.RemoteTarget
,
src.target.Target
read_0grads() :
src.target.Target
read_arc() :
src.molecule.Molecule
read_charmm() :
src.molecule.Molecule
read_com() :
src.molecule.Molecule
read_comm_charge_mult() :
src.molecule.Molecule
read_data() :
src.lipid.Lipid
,
src.liquid.Liquid
read_dcd() :
src.molecule.Molecule
read_gro() :
src.molecule.Molecule
read_inpcrd() :
src.molecule.Molecule
read_mdcrd() :
src.molecule.Molecule
read_mol2() :
src.molecule.Molecule
read_pdb() :
src.molecule.Molecule
read_qcesp() :
src.molecule.Molecule
read_qcin() :
src.molecule.Molecule
read_qcout() :
src.molecule.Molecule
read_qcschema() :
src.molecule.Molecule
read_qdata() :
src.molecule.Molecule
read_reference_data() :
src.abinitio.AbInitio
,
src.hydration.Hydration
,
src.interaction.Interaction
,
src.moments.Moments
,
src.torsion_profile.TorsionProfileTarget
,
src.vibration.Vibration
read_xyz() :
src.molecule.Molecule
read_xyz0() :
src.molecule.Molecule
readchk() :
src.optimizer.Optimizer
readsrc() :
src.amberio.AMBER
,
src.engine.Engine
,
src.gmxio.GMX
,
src.smirnoffio.SMIRNOFF
,
src.tinkerio.TINKER
recover() :
src.optimizer.Optimizer
ref_rmsd() :
src.molecule.Molecule
refresh_temp_directory() :
src.target.Target
removeHandler() :
src.output.ForceBalanceLogger
reorder_according_to() :
src.molecule.Molecule
reorder_indices() :
src.molecule.Molecule
repair() :
src.molecule.Molecule
replace_peratom() :
src.molecule.Molecule
replace_peratom_conditional() :
src.molecule.Molecule
require() :
src.molecule.Molecule
require_boxes() :
src.molecule.Molecule
require_resid() :
src.molecule.Molecule
require_resname() :
src.molecule.Molecule
retrieve() :
src.thermo.Thermo
rigid_water() :
src.molecule.Molecule
rotate_bond() :
src.molecule.Molecule
rotate_check_clash() :
src.molecule.Molecule
rsmake() :
src.ffyapf.FF
,
src.forcefield.FF
Run() :
src.optimizer.Optimizer
run_simulation() :
src.hydration.Hydration
Generated on Thu Jul 9 2020 11:51:12 for ForceBalance API by
1.8.13