Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:
- g -
- gas_engine
: src.lipid.Lipid
, src.liquid.Liquid
- gas_engine_args
: src.amberio.Liquid_AMBER
, src.gmxio.Liquid_GMX
, src.smirnoffio.Liquid_SMIRNOFF
, src.tinkerio.Liquid_TINKER
- gas_engines
: src.hydration.Hydration
- gas_mol
: src.liquid.Liquid
- GBSfnm
: src.psi4io.THCDF_Psi4
- gct
: src.target.Target
- generate_positions()
: src.gmxio.GMX
- GeneticAlgorithm()
: src.optimizer.Optimizer
- get()
: src.abinitio.AbInitio
, src.binding.BindingEnergy
, src.counterpoise.Counterpoise
, src.evaluator_io.Evaluator_SMIRNOFF
, src.hydration.Hydration
, src.interaction.Interaction
, src.leastsq.LeastSquares
, src.lipid.Lipid
, src.liquid.Liquid
, src.moments.Moments
, src.opt_geo_target.OptGeoTarget
, src.psi4io.RDVR3_Psi4
, src.target.RemoteTarget
, src.target.Target
, src.thermo.Thermo
, src.torsion_profile.TorsionProfileTarget
, src.vibration.Vibration
- get14Interactions()
: src.amberio.PrmtopLoader
- get_atom()
: src.Mol2.mol2
- get_bonded_atoms()
: src.Mol2.mol2
- get_charges()
: src.amberio.AMBER
, src.gmxio.GMX
, src.tinkerio.TINKER
- get_energy_force()
: src.abinitio.AbInitio
- get_exp()
: src.hydration.Hydration
- get_G()
: src.target.Target
- get_H()
: src.target.Target
- get_mathid()
: src.forcefield.FF
- get_normal()
: src.liquid.Liquid
- get_populations()
: src.molecule.Molecule
- get_pure_num_grad()
: src.liquid.Liquid
- get_reaxff_atom_types()
: src.molecule.Molecule
- get_resp()
: src.abinitio.AbInitio
- get_smirks_counter()
: src.smirnoffio.SMIRNOFF
- get_sp()
: src.hydration.Hydration
- get_ti2()
: src.hydration.Hydration
- get_X()
: src.target.Target
- getAngles()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getAtomName()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getAtomNames()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getAtomType()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getAtomTypes()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getBondsNoH()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getBondsWithH()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getBoxBetaAndDimensions()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getCharges()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getDihedrals()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getExcludedAtoms()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getGBParms()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getIfBox()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getIfCap()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getIfPert()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getMasses()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getNonbondTerms()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getNumAtoms()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getNumTypes()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getResidueLabel()
: src.amberio.PrmtopLoader
- getResidueNumber()
: src.amberio.PrmtopLoader
- gmx_defs
: src.gmxio.GMX
- gmx_eq_barostat
: src.gmxio.GMX
- gmxpath
: src.gmxio.GMX
- gmxsuffix
: src.gmxio.GMX
- gmxversion
: src.gmxio.GMX
- goodstep
: src.optimizer.Optimizer
, src.target.Target
- Gp
: src.lipid.Lipid
, src.liquid.Liquid
, src.thermo.Thermo
- Grad
: src.optimizer.Optimizer
- gradd
: src.psi4io.RDVR3_Psi4
- Gradient()
: src.optimizer.Optimizer