Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:
- m -
- M_orig
: src.abinitio.AbInitio
- MainOptimizer()
: src.optimizer.Optimizer
- make()
: src.ffyapf.FF
, src.forcefield.FF
- make_gro_trajectory()
: src.gmxio.GMX
- make_redirect()
: src.ffyapf.FF
, src.forcefield.FF
- make_rescale()
: src.ffyapf.FF
, src.forcefield.FF
- map
: src.ffyapf.FF
, src.forcefield.FF
- MAQ
: src.leastsq.LeastSquares
- maxdf
: src.abinitio.AbInitio
- maxfatom
: src.abinitio.AbInitio
- maxfshot
: src.abinitio.AbInitio
- maxid()
: src.target.Target
- maxrd()
: src.target.Target
- MBarEnergy
: src.lipid.Lipid
, src.liquid.Liquid
- md()
: src.gmxio.GMX
- md_trajectory
: src.tinkerio.TINKER
- mdene
: src.gmxio.GMX
- mdin
: src.amberio.AMBER
- mdp
: src.gmxio.GMX
- mdpfx
: src.gmxio.Thermo_GMX
- mdtraj
: src.gmxio.GMX
- measure_angles()
: src.molecule.Molecule
- measure_dihedrals()
: src.molecule.Molecule
- measure_distances()
: src.molecule.Molecule
- meta_get()
: src.target.Target
- meta_indicate()
: src.target.Target
- metadata
: src.torsion_profile.TorsionProfileTarget
- mfnm
: src.moments.Moments
- mktransmat()
: src.ffyapf.FF
, src.forcefield.FF
- mmopts
: src.smirnoffio.SMIRNOFF
- mname
: src.amberio.AMBER
- mod
: src.smirnoffio.SMIRNOFF
- mol
: src.abinitio.AbInitio
, src.amberio.AMBER
, src.amberio.Mol2_Reader
, src.gmxio.GMX
, src.gmxio.ITP_Reader
, src.interaction.Interaction
, src.smirnoffio.SMIRNOFF
, src.tinkerio.TINKER
, src.torsion_profile.TorsionProfileTarget
- mol2
: src.amberio.AMBER
, src.smirnoffio.SMIRNOFF
- mol_name
: src.Mol2.mol2
- mol_type
: src.Mol2.mol2
- molatom
: src.amberio.Mol2_Reader
, src.BaseReader
, src.gmxio.ITP_Reader
- molecular_dynamics()
: src.amberio.AMBER
, src.gmxio.GMX
, src.tinkerio.TINKER
- Molecules
: src.BaseReader
- molecules
: src.hydration.Hydration
, src.molecule.Molecule
, src.psi4io.RDVR3_Psi4
- Molecules
: src.psi4io.THCDF_Psi4
- MP2_Energy
: src.psi4io.THCDF_Psi4
- mult
: src.molecule.Molecule
- multipole_moments()
: src.amberio.AMBER
, src.gmxio.GMX
, src.tinkerio.TINKER
- mvals0
: src.optimizer.Optimizer
- mvals_bak
: src.optimizer.Optimizer