- a -

• A : src.amberio.AMBER
• a : src.objective.Penalty
• A : src.smirnoffio.SMIRNOFF , src.tinkerio.TINKER
• absfrcmod : src.amberio.AMBER
• abskey : src.tinkerio.TINKER
• absleap : src.amberio.AMBER
• absmdin : src.amberio.AMBER
• absmol2 : src.amberio.AMBER
• abspdb : src.amberio.AMBER , src.smirnoffio.SMIRNOFF
• adict : src.amberio.FrcMod_Reader , src.BaseReader , src.psi4io.GBS_Reader
• AllResults : src.liquid.Liquid
• amber_frcmod : src.ffyapf.FF , src.forcefield.FF
• amber_mol2 : src.ffyapf.FF , src.forcefield.FF
• amberhome : src.amberio.AMBER
• amom : src.psi4io.GBS_Reader
• asym : src.abinitio.AbInitio
• atom : src.amberio.FrcMod_Reader , src.amberio.Mol2_Reader , src.qchemio.QCIn_Reader , src.tinkerio.Tinker_Reader
• atom_id : src.Mol2.mol2_atom
• atom_name : src.Mol2.mol2_atom
• atom_type : src.Mol2.mol2_atom
• AtomLists : src.abinitio.AbInitio , src.amberio.AMBER , src.gmxio.GMX , src.smirnoffio.SMIRNOFF , src.tinkerio.TINKER
• AtomMask : src.abinitio.AbInitio , src.amberio.AMBER , src.gmxio.GMX , src.smirnoffio.SMIRNOFF , src.tinkerio.TINKER
• atomname : src.molecule.Molecule
• atomnames : src.amberio.Mol2_Reader , src.ffyapf.FF , src.forcefield.FF , src.gmxio.ITP_Reader
• atoms : src.Mol2.mol2
• atomtype_to_mass : src.gmxio.ITP_Reader
• AtomTypes : src.BaseReader
• atomtypes : src.gmxio.ITP_Reader