Here is a list of all namespace members with links to the namespace documentation for each member:

- a -

• A : src.chemistry
• add_strip_to_mat() : src.molecule
• AddVirtualSiteBonds() : src.openmmio
• aftypes : src.gmxio
• AlignToDensity() : src.molecule
• AlignToMoments() : src.molecule
• Alive : src.molecule
• all : ForceBalance
• all_opts_names : src.parser
• allp : src.tinkerio
• allsplit() : src.nifty
• AllVariableNames : src.molecule
• ambervel2au : src.nifty
• amu2au : src.nifty
• amu_mass : src.nifty
• ang2bohr : src.nifty
• arc() : src.molecule
• assign_openff_parameter() : src.smirnoffio
• astr() : src.nifty
• at_cached_assign_partial_charges() : src.smirnoff_hack
• at_original_assign_partial_charges : src.smirnoff_hack
• AT_TOOLKIT_CACHE_assign_partial_charges : src.smirnoff_hack
• AtomContact() : src.molecule
• atoms : src.chemistry
• AtomVariableNames : src.molecule
• au2evang : src.nifty
• au2kcal : src.nifty
• au2kj : src.nifty
• au_mass : src.nifty
• avogadro : src.nifty
• axis_angle() : src.molecule