- s -

• save_vmvals : src.abinitio.AbInitio
• SavedMVal : src.lipid.Lipid
• SavedTraj : src.lipid.Lipid , src.liquid.Liquid
• savg : src.abinitio.AbInitio
• scripts : src.amberio.Liquid_AMBER , src.gmxio.Lipid_GMX , src.gmxio.Liquid_GMX , src.gmxio.Thermo_GMX , src.smirnoffio.Liquid_SMIRNOFF , src.tinkerio.Liquid_TINKER
• sec : src.custom_io.Gen_Reader , src.gmxio.ITP_Reader , src.qchemio.QCIn_Reader
• section : src.amberio.Mol2_Reader
• select1 : src.interaction.Interaction
• select2 : src.interaction.Interaction
• shell : src.qchemio.QCIn_Reader
• simkwargs : src.smirnoffio.SMIRNOFF
• simpfx : src.thermo.Thermo
• smin : src.abinitio.AbInitio , src.torsion_profile.TorsionProfileTarget
• snum : src.qchemio.QCIn_Reader
• spacings : src.objective.Penalty
• spath : src.amberio.AMBER
• srcdir : src.engine.Engine
• status_bit : src.Mol2.mol2_atom , src.Mol2.mol2_bond
• stream : src.nifty.RawFileHandler
• subst_id : src.Mol2.mol2_atom
• subst_name : src.Mol2.mol2_atom
• suffix : src.amberio.FrcMod_Reader , src.amberio.Mol2_Reader , src.BaseReader , src.custom_io.Gen_Reader , src.gmxio.ITP_Reader , src.qchemio.QCIn_Reader , src.tinkerio.Tinker_Reader
• surf_ten_mol : src.liquid.Liquid
• sys_opts : src.opt_geo_target.OptGeoTarget
• system : src.smirnoffio.SMIRNOFF
• system_mval_masks : src.smirnoffio.OptGeoTarget_SMIRNOFF